استفاده از پلی مورفیسم طولی نواحی its1 وits2 موجود در dna ریبوزومی جهت تعیین گونه ی مخمرهای بیماریزای انسان براساس الگوی الکتروفورزی محصولات pcr

پایان نامه
  • وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده علوم پایه
  • نویسنده لادن کریمی
  • استاد راهنما حسین میرهندی
  • سال انتشار 1391
چکیده

گونه های مخمری نقش مهمی را در مرگ و میر بیماران دارای نقص ایمنی ایفا می کنند. در مطالعه حاضر از پلی مورفیسم قطعات طولی internal transcribed spacer موجود در dna ریبوزومی برای شناسایی مهمترین و شایع ترین گونه های مخمری پزشکی از میان نمونه های بالینی استفاده شده است. نواحی its1 و its2 214 سوش قارچی شامل 30 سوش استانداردو 184 نمونه بالینی توسط روش pcr با استفاده از دو جفت پرایمر (its1-its2) و (its3-its4) به طور مجزا تکثیر شدند. محصولات pcr بدست آمده از تکثیر دو ناحیه به طور مساوی با هم مخلوط شدند و الگوی الکتروفورزی آنها بر روی ژل آگاروز با توجه به اندازه نواحی its استخراج شده از بانک ژنی بررسی شد. اکثر نمونه های بالینی الگوی fsp مشابه با الگوی پیش بینی شده از آنالیز تواالی های بانک ژنی را نشان دادند. شایع ترین گونه های مخمری عامل عفونت نظیر کاندیدا آلبیکنس، کاندیدا تروپیکالیس، کاندیدا گلابراتا، کاندیدا کفیر، کاندیدا کروزه ای، کاندیدا لوزیتانیا و کاندیدا گلیرموندی با روش pcr-fsp قابل شناسایی هستند. اندازه نواحی its1 و its2 برای گونه های بیماریزای قارچی به اندازه کافی متفاوت است و موجب شناسایی نمونه های بالینی توسط الگوی اختصاصی الکتروفورز ژل آگاروز می شود.با این روش قادر به شناسایی و تمایز تقریبا تمامی مخمرهای پاتوژن حدود 35 گونه مخمری بدون استفاده از ابزار گران قیمت نظیر تعیین توالی و الکتروفورز مویینه می باشیم. این متد روشی ساده برای بکارگیری در تحقیقات مولکولی در جهت شناسایی تعداد بسیاری از گونه های مخمری می باشد و همچنین برای اهداف تشخیصی در آزمایشگاههای مرجع و مطالعات اپیدمیولوژیک کاربرد دارد.

منابع مشابه

بررسی تفاوت‌های ژنتیکی پاتوتایپ‌های زنگ قهوه‌ای گندم ایران بر اساس تعیین توالی ناحیه ITS1

سابقه و هدف: بیماری زنگ قهوه‌ای (زنگ برگی) گندم یکی از بیماری‌های مهم گندم است که توسط قارچ Puccinia triticina Erikson ایجاد می‌شود. در سال‌های اخیر توالی‌یابی نواحی مختلف DNA ریبوزومی به ویژه ناحیه ITS1 به منظور بررسی تفاوت‌های ژنتیکی پاتوتایپ‌های عوامل بیماریزای زنگ‌های مختلف گندم مورد استفاده قرار گرفته است. هدف از انجام این پژوهش، بررسی تشابهات و تفاوت‌های موجود بین پاتوتا...

متن کامل

بررسی تفاوت‌های ژنتیکی پاتوتایپ‌های زنگ قهوه‌ای گندم ایران بر اساس تعیین توالی ناحیه ITS1

سابقه و هدف: بیماری زنگ قهوه‌ای (زنگ برگی) گندم یکی از بیماری‌های مهم گندم است که توسط قارچ Puccinia triticina Erikson ایجاد می‌شود. در سال‌های اخیر توالی‌یابی نواحی مختلف DNA ریبوزومی به ویژه ناحیه ITS1 به منظور بررسی تفاوت‌های ژنتیکی پاتوتایپ‌های عوامل بیماریزای زنگ‌های مختلف گندم مورد استفاده قرار گرفته است. هدف از انجام این پژوهش، بررسی تشابهات و تفاوت‌های موجود بین پاتوتا...

متن کامل

بررسی پلی مورفیسم در جو با استفاده از روش STS-PCR

به منظور برریس پلی مورفیسم در DNA جو های ژاپنی؛ تعداد 117 آغازگر STS در دو تیپ مختلف مورد استفاده قرار گرفت که تنها 92 آغازگر در واکنش PCR تولید نوار کردند. از این تعداد 16 آغازگر بدون استفاده از آنزیم های برشی و 24 آغازگر پس از برش نوارهای حاصل از واکنش PCR بوسیله آنزیم های برشی؛ پلی مورفیسم نشان دادند. فراوانی محل های برش کمتر از فراوانی مورد انتظار و پراکندگی آنها بر روی قطعات DNA نایکنواخت ...

متن کامل

مطالعه پلی مورفیسم dna میتوکندریایی در زنبور عسل ایرانی با استفاده از روش pcr-rflp

چکیده: شناسایی جمعیت های زنبور عسل یکی از اهداف مهم در اصلاح نژاد زنبور عسل است. جنس آپیس یا زنبور عسل دارای چهار گونه اصلی می باشد که آپیس ملیفرا یکی از متنوع ترین گونه های زنبور عسل می باشد. آپیس ملیفرا تنها گونه زنبور عسل است که دارای زیر گونه های زیادی است و زیر گونه زنبور عسل ایرانی به نام آپیس ملیفرا مدا نامگذاری شده است. بررسی پلی مورفیسم dna میتوکندریایی در چندین زمینه از مطالعات جانوری...

استفاده از روش Fast PCR جهت تشخیص گونه های فاسیولا

Background and purpose: Fasciola hepatica and Fasciola gigantica are common liver flukes that are the etiological agents of fasciolosis, which affects both domestic livestock and humans worldwide. In the present study we established a rapid, easy and also accurate tool, for differentiation between F. hepatica and F. gigantica using Fast PCR. Material and methods: Thirty adults of Fasciola spec...

متن کامل

بررسی تفاوت های ژنتیکی پاتوتایپ های زنگ قهوه ای گندم ایران بر اساس تعیین توالی ناحیه its۱

سابقه و هدف: بیماری زنگ قهوه ای (زنگ برگی) گندم یکی از بیماری های مهم گندم است که توسط قارچ puccinia triticina erikson ایجاد می شود. در سال های اخیر توالی یابی نواحی مختلف dna ریبوزومی به ویژه ناحیه its1 به منظور بررسی تفاوت های ژنتیکی پاتوتایپ های عوامل بیماریزای زنگ های مختلف گندم مورد استفاده قرار گرفته است. هدف از انجام این پژوهش، بررسی تشابهات و تفاوت های موجود بین پاتوتایپ های عوامل بیمار...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده علوم پایه

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023